159 Skills · 9 Categories

AI Skills
Catalog

Claude Code / Gemini CLI 技能目錄 — 收錄 159 個 AI Skills,涵蓋資料庫存取、生物資訊、資料科學、學術寫作等領域。

Skills 來源

📄

DOCX

Word 文件工具包(.docx)。建立/編輯文件、追蹤修訂、註解、格式保留、文字擷取。

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📕

PDF

PDF 操作工具包。擷取文字/表格、建立 PDF、合併/分割、填寫表單、OCR 掃描。

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📊

PPTX

簡報工具包(.pptx)。建立/編輯投影片、版面配置、講者備忘稿、合併/分割檔案。

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📗

XLSX

試算表工具包(.xlsx/.csv)。建立/編輯含公式/格式、資料清理、圖表視覺化。

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🎨

Algorithmic Art

使用 p5.js 創作演算法藝術。支援種子隨機、互動參數探索、流場、粒子系統等生成式藝術。

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🏷️

Brand Guidelines

套用 Anthropic 官方品牌色彩與字型到各種產出物。適用於需要品牌一致性的視覺設計。

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🖼️

Canvas Design

以設計哲學創作精美視覺藝術。支援 .png 和 .pdf 輸出,適用於海報、藝術作品等靜態設計。

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✍️

Doc Co-authoring

結構化文件共同撰寫工作流程。適用於撰寫文件、提案、技術規格書、決策文件等。

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💻

Frontend Design

建立高品質前端介面與 UI 設計。支援網站、Landing Page、儀表板、React 元件等,避免制式 AI 風格。

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📨

Internal Comms

撰寫各類企業內部溝通文件。狀態報告、主管更新、公司通訊、FAQ、事件報告等。

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🔌

MCP Builder

建立高品質 MCP(Model Context Protocol)伺服器。支援 Python(FastMCP)和 Node/TypeScript SDK 整合外部 API。

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🧩

Skill Creator

建立新 Skill、改善現有 Skill、執行評估測試。支援從零開始建立、效能基準測試與觸發精準度優化。

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🎬

Slack GIF Creator

建立針對 Slack 最佳化的動畫 GIF。提供尺寸限制、驗證工具與動畫概念參考。

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🎭

Theme Factory

為各種產出物套用主題樣式。內建 10 種預設主題(色彩/字型),可套用於投影片、文件、網頁等。

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🌐

Web Artifacts Builder

建立複雜的多元件網頁應用。使用 React、Tailwind CSS、shadcn/ui,支援狀態管理與路由。

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🧪

Webapp Testing

使用 Playwright 測試本地網頁應用。驗證前端功能、除錯 UI 行為、擷取螢幕截圖、檢視瀏覽器日誌。

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🧬

Alphafold Database

存取 AlphaFold 2 億+ AI 預測蛋白質結構。透過 UniProt ID 擷取結構、下載 PDB/mmCIF 檔案,分析信賴度指標。

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🗄️

Biorxiv Database

搜尋 bioRxiv 生命科學預印本伺服器。依關鍵字、作者、日期範圍搜尋,擷取論文元資料。

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🗄️

Brenda Database

存取 BRENDA 酶資料庫。擷取動力學參數(Km、kcat)、反應方程式、物種資料與底物特異性酵素資訊。

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🗄️

Chembl Database

查詢 ChEMBL 生物活性分子與藥物探索資料。依結構/性質搜尋化合物,擷取生物活性數據(IC50、Ki)。

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🏥

Clinicaltrials Database

透過 API v2 查詢 ClinicalTrials.gov。依疾病、藥物、地點、狀態或期別搜尋臨床試驗。

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🗄️

Clinpgx Database

存取 ClinPGx 藥物基因體學資料。查詢基因-藥物交互作用、CPIC 指引、等位基因功能,支援精準醫療。

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🗄️

Clinvar Database

查詢 NCBI ClinVar 變異臨床意義。依基因/位置搜尋,解讀致病性分類,用於基因體醫學。

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🗄️

Cosmic Database

存取 COSMIC 癌症突變資料庫。查詢體細胞突變、癌症基因普查、突變特徵、基因融合。

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💊

Drugbank Database

存取 DrugBank 綜合藥物資訊,包含藥物性質、交互作用、標靶、途徑、化學結構與藥理資料。

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🗄️

Ena Database

透過 API/FTP 存取歐洲核苷酸檔案庫。擷取 DNA/RNA 序列、原始讀取(FASTQ)、基因體組裝。

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🗄️

Ensembl Database

查詢 Ensembl 基因體資料庫 REST API,支援 250+ 物種。基因查詢、序列擷取、變異分析、比較基因體學。

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💊

FDA Database

查詢 openFDA API,含藥品、醫材、不良事件、召回、法規送件(510k、PMA)等資料。

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💹

Fred Economic Data

查詢 FRED 聯邦準備經濟資料 API,含 80 萬+ 經濟時間序列,涵蓋 GDP、失業率、通膨、利率等。

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🗄️

Gene Database

透過 E-utilities/Datasets API 查詢 NCBI Gene。依基因符號/ID 搜尋,擷取基因資訊(RefSeqs、GO、位置)。

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🗄️

GEO Database

存取 NCBI GEO 基因表現/基因體資料。搜尋/下載微陣列與 RNA-seq 資料集(GSE、GSM、GPL)。

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🗄️

Gwas Database

查詢 NHGRI-EBI GWAS Catalog,搜尋 SNP-性狀關聯。依 rs ID、疾病/性狀、基因搜尋,擷取 p 值與統計摘要。

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🗄️

Hmdb Database

存取人類代謝體資料庫(22 萬+ 代謝物)。依名稱/ID/結構搜尋,擷取化學性質、生物標記資料、NMR/MS 光譜。

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🏥

Imaging Data Commons

查詢與下載 NCI 影像資料共享中心的公開癌症影像資料,含 CT、MR、PET 與病理資料集。

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🗺️

Kegg Database

直接 REST API 存取 KEGG。途徑分析、基因-途徑對應、代謝途徑、藥物交互作用、ID 轉換。

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🗄️

Metabolomics Workbench Database

透過 REST API 存取 NIH 代謝體工作台(4,200+ 研究)。查詢代謝物、RefMet 命名、MS/NMR 資料。

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🗄️

Openalex Database

使用 OpenAlex 資料庫查詢與分析學術文獻。搜尋論文、分析研究趨勢、查找作者或機構的著作。

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🗄️

Opentargets Database

查詢 Open Targets 平台,含標靶-疾病關聯、藥物標靶探索、遺傳學/體學證據,用於治療標靶鑑定。

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🗄️

PDB Database

存取 RCSB PDB 3D 蛋白質/核酸結構。依文字/序列/結構搜尋,下載座標(PDB/mmCIF),用於結構生物學。

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🗄️

Pubchem Database

透過 PUG-REST API 查詢 PubChem(1.1 億+ 化合物)。依名稱/CID/SMILES 搜尋,擷取性質、相似性搜尋。

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Pubmed Database

直接 REST API 存取 PubMed。進階布林/MeSH 查詢、E-utilities API、批次處理、引文管理。

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Reactome Database

查詢 Reactome REST API,含途徑分析、富集分析、基因-途徑對應、疾病途徑、分子交互作用。

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🗄️

String Database

查詢 STRING API,含蛋白質-蛋白質交互作用(5,900 萬蛋白質、200 億交互作用)。網路分析、GO/KEGG 富集。

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🗄️

Uniprot Database

直接 REST API 存取 UniProt。蛋白質搜尋、FASTA 擷取、ID 對應、Swiss-Prot/TrEMBL。

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🗄️

Uspto Database

存取 USPTO API,含專利/商標搜尋、審查歷程(PEDS)、轉讓、引用,用於智慧財產分析。

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🗄️

Zinc Database

存取 ZINC(2.3 億+ 可購買化合物)。依 ZINC ID/SMILES 搜尋、相似性搜尋、3D 結構,用於虛擬篩選。

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Anndata

單細胞分析中的標註矩陣資料結構。處理 .h5ad 檔案或與 scverse 生態系統整合時使用。

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Arboreto

從基因表現資料推斷基因調控網路(GRN),使用 GRNBoost2、GENIE3 等可擴展演算法。

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Biopython

綜合分子生物學工具包。序列操作、檔案解析(FASTA/GenBank/PDB)、系統發生學、NCBI/PubMed 程式化存取。

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Bioservices

統一 Python 介面存取 40+ 生物資訊服務。同時查詢 UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome 等多個資料庫。

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Cellxgene Census

程式化查詢 CELLxGENE Census(6,100 萬+ 細胞)。跨組織、疾病、細胞類型取得表現資料。

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Cobrapy

基於約束的代謝建模(COBRA)。FBA、FVA、基因敲除、通量取樣、SBML 模型,用於系統生物學。

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Deeptools

NGS 分析工具包。BAM 轉 bigWig、品質控制(相關性、PCA)、熱圖/輪廓圖,用於 ChIP-seq、RNA-seq 視覺化。

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Etetoolkit

系統發生樹工具包(ETE)。樹操作(Newick/NHX)、演化事件偵測、直系/旁系同源、NCBI 分類學、視覺化。

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Flowio

解析 FCS(流式細胞儀標準)檔案 v2.0-3.1。以 NumPy 陣列擷取事件、讀取元資料/通道。

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Geniml

處理基因體區間資料(BED 檔案)的機器學習工具。訓練區域嵌入(Region2Vec)、單細胞 ATAC-seq 分析。

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Gget

快速 CLI/Python 查詢 20+ 生物資訊資料庫。基因資訊查詢、BLAST 搜尋、AlphaFold 結構、富集分析。

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Gtars

高效能基因體區間分析工具(Rust + Python)。處理 BED 檔案、覆蓋度追蹤、重疊偵測、ML 模型代幣化。

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Histolab

輕量全切片影像(WSI)切塊擷取與前處理。組織偵測、切塊擷取、H&E 染色正規化。

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Lamindb

LaminDB 生物學資料框架。管理生物資料集(scRNA-seq、影像、基因體學),使資料可查詢、可追蹤、可重現。

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Neuropixels Analysis

Neuropixels 神經記錄分析。載入 SpikeGLX/OpenEphys 資料、前處理、運動校正、Kilosort4 尖峰排序。

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Pathml

全功能計算病理學工具包。進階 WSI 分析,含多重免疫螢光、細胞核分割、組織圖建構、ML 模型訓練。

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Pydeseq2

差異基因表現分析(Python DESeq2)。從批量 RNA-seq 計數識別差異表現基因、Wald 檢定、FDR 校正。

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Pyopenms

完整質譜分析平台。蛋白質體學工作流程:特徵偵測、肽段鑑定、蛋白質定量、LC-MS/MS 管線。

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Pysam

基因體檔案工具包。讀寫 SAM/BAM/CRAM 比對、VCF/BCF 變異、FASTA/FASTQ 序列,用於 NGS 資料處理。

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Scanpy

標準單細胞 RNA-seq 分析管線。品質控制、正規化、降維(PCA/UMAP/t-SNE)、分群、差異表現、視覺化。

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Scikit Bio

生物資料工具包。序列分析、比對、系統發生樹、多樣性指標(alpha/beta、UniFrac)、排序,用於微生物體分析。

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Scvi Tools

單細胞體學深度生成模型。機率性批次校正(scVI)、遷移學習、帶不確定性的差異表現、多模態整合。

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Adaptyv

自動化蛋白質測試與驗證的雲端實驗室平台。設計蛋白質時進行實驗驗證,含結合分析、表現測試。

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⚗️

Datamol

RDKit 的 Python 友善包裝。標準藥物探索工具:SMILES 解析、標準化、描述子、指紋、分群、3D 構形。

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🧪

Deepchem

分子機器學習。多元特徵化器與預建資料集,用於性質預測(ADMET、毒性)、GNN、MoleculeNet 基準測試。

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Diffdock

基於擴散的分子對接。從 PDB/SMILES 預測蛋白質-配體結合姿態、信賴度評分、虛擬篩選,用於結構導向藥物設計。

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Esm

蛋白質語言模型工具包,含 ESM3(跨序列、結構、功能的生成式多模態蛋白質設計)與 ESM C(高效嵌入)。

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⚗️

Matchms

質譜相似度與化合物鑑定。比較質譜、計算相似度分數(餘弦、修正餘弦),用於代謝體學。

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⚗️

Medchem

藥物化學篩選。藥物相似性規則(Lipinski、Veber)、PAINS 過濾器、結構警示、複雜度指標,用於化合物優先排序。

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⚗️

Molfeat

分子特徵化(100+ 特徵化器)。ECFP、MACCS、描述子、預訓練模型(ChemBERTa),SMILES 轉特徵,用於 QSAR。

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⚗️

Pymatgen

材料科學工具包。晶體結構(CIF、POSCAR)、相圖、能帶結構、DOS、Materials Project 整合。

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⚗️

Pytdc

Therapeutics Data Commons。AI 就緒的藥物探索資料集(ADME、毒性、DTI)、基準測試、分子預言機。

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⚗️

Rdkit

化學資訊學工具包。SMILES/SDF 解析、描述子(MW、LogP、TPSA)、指紋、子結構搜尋、2D/3D 生成。

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⚗️

Rowan

雲端量子化學平台。pKa 預測、幾何最佳化、構形搜尋、分子性質計算。

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⚗️

Torchdrug

PyTorch 原生圖神經網路,用於分子與蛋白質。建構自訂 GNN 架構,用於藥物探索與蛋白質建模。

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🤖

Aeon

時間序列機器學習工具。分類、迴歸、分群、預測、異常偵測、分割與相似性搜尋。

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Astropy

天文學與天體物理學 Python 函式庫。天體座標、物理單位、FITS 檔案、宇宙學計算。

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Cirq

Google 量子計算框架。設計雜訊感知電路、量子特性化實驗,針對 Google Quantum AI 硬體優化。

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Dask

分散式運算,處理超過記憶體的 pandas/NumPy 工作流程。平行檔案處理、分散式 DataFrame。

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🤖

Datacommons Client

存取 Data Commons 平台公開統計資料,含人口統計、經濟指標、健康統計、環境資料。

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Fluidsim

計算流體力學模擬框架。Navier-Stokes 方程式(2D/3D)、淺水方程式、分層流。

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🗺️

Geopandas

地理空間向量資料 Python 函式庫。處理 shapefiles、GeoJSON、GeoPackage,空間分析與幾何運算。

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🤖

Hypogenic

LLM 驅動的假說自動生成與測試。在表格資料集上系統性探索假說與模式。

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🧮

Matlab

MATLAB 與 GNU Octave 數值計算。矩陣運算、資料分析、視覺化、科學計算。

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☁️

Modal

雲端無伺服器容器執行 Python 程式碼,支援 GPU 與自動縮放。部署 ML 模型、批次處理任務。

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🕸️

Networkx

Python 複雜網路與圖分析工具包。建立、分析與視覺化網路與圖結構。

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⚛️

Pennylane

硬體無關量子 ML 框架,支援自動微分。訓練量子電路、建構混合量子-古典模型。

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Polars

高速記憶體內 DataFrame 函式庫。延遲求值、平行執行、Apache Arrow 後端,處理 1-100GB 資料。

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🤖

Pufferlib

高效能強化學習框架,最佳化速度與規模。快速平行訓練、向量化環境、多代理系統。

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🤖

Pymc Bayesian Modeling

PyMC 貝氏建模。建構階層模型、MCMC(NUTS)、變分推論、LOO/WAIC 比較、後驗檢查。

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🤖

Pymoo

多目標最佳化框架。NSGA-II、NSGA-III、MOEA/D、Pareto 前沿、約束處理,用於工程設計最佳化。

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Pytorch Lightning

深度學習框架(PyTorch Lightning)。組織 PyTorch 程式碼、多 GPU/TPU 訓練、資料管線、回呼、紀錄。

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Qiskit

IBM 量子計算框架。針對 IBM Quantum 硬體、Qiskit Runtime 生產工作負載、IBM 最佳化工具。

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⚛️

Qutip

開放量子系統物理模擬函式庫。主方程式、Lindblad 動力學、去同調、量子光學。

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🤖

Scikit Learn

Python 機器學習。監督式學習(分類、迴歸)、非監督式學習(分群、降維)、模型評估、超參數調整。

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🤖

Scikit Survival

存活分析與事件時間建模工具包。處理設限資料、Cox 比例風險模型、隨機存活森林。

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🔍

Shap

模型可解釋性(SHAP 值)。解釋 ML 模型預測、計算特徵重要性、生成 SHAP 圖表。

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⏱️

Simpy

Python 離散事件模擬框架。建構含流程、佇列、資源與時間事件的系統模擬。

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🤖

Stable Baselines3

生產就緒強化學習演算法(PPO、SAC、DQN、TD3、A2C),scikit-learn 風格 API。

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🤖

Statsmodels

Python 統計模型函式庫。OLS、GLM、混合模型、ARIMA,含詳細診斷、殘差與推論。

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🔢

Sympy

Python 符號數學。代數方程式求解、微積分運算(微分、積分)、線性代數、離散數學。

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🤖

Torch Geometric

圖神經網路(PyG)。節點/圖分類、連結預測、GCN、GAT、GraphSAGE、異質圖、分子性質預測。

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🧠

Transformers

預訓練 Transformer 模型。自然語言處理、電腦視覺、音訊、多模態任務,含文本生成、分類。

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🤖

Umap Learn

UMAP 降維。快速非線性流形學習,用於 2D/3D 視覺化、分群前處理(HDBSCAN)。

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Vaex

處理超大表格資料集(數十億列),超出可用 RAM。核外 DataFrame 運算、延遲求值、快速聚合。

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💾

Zarr Python

分塊 N-D 陣列,用於雲端儲存。壓縮陣列、平行 I/O、S3/GCS 整合、NumPy/Dask/Xarray 相容。

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📎

Citation Management

學術研究引文管理。搜尋 Google Scholar 與 PubMed 論文、擷取元資料、驗證引文、生成 BibTeX。

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💡

Hypothesis Generation

從觀察結果進行結構化假說形成。制定可測試假說與預測、提出機制、設計實驗。

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📚

Literature Review

使用多個學術資料庫(PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar)進行系統性文獻回顧。

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🌐

Paper 2 Web

將學術論文轉換為推廣與展示格式,含互動式網站(Paper2Web)、簡報影片、會議海報。

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🔬

Peer Review

結構化稿件/計畫審查,含檢核表式評估。方法學評估、統計有效性、報告標準合規性。

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💰

Research Grants

撰寫具競爭力的研究計畫書,支援 NSF、NIH、DOE、DARPA 及台灣國科會格式與審查標準。

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🔍

Research Lookup

使用 Perplexity AI 搜尋查詢最新研究資訊。自動依查詢複雜度選擇最佳模型。

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🎓

Scholar Evaluation

使用 ScholarEval 框架系統性評估學術著作,涵蓋研究品質、方法學、分析與寫作。

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🧠

Scientific Brainstorming

創意研究發想與探索。跨領域連結、挑戰假設、識別研究缺口,適合研究早期階段。

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🤔

Scientific Critical Thinking

評估科學主張與證據品質。實驗設計有效性、識別偏差與混淆因子、GRADE 證據分級。

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✍️

Scientific Writing

科學手稿撰寫核心技能。以完整段落撰寫(非條列式),使用兩階段流程:大綱 + 全文撰寫。

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📄

Venue Templates

主要科學期刊與會議的 LaTeX 模板、格式要求與投稿指南(Nature、Science、PLOS、IEEE、ACM)。

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🔗

Benchling Integration

Benchling R&D 平台整合。存取登記表(DNA、蛋白質)、庫存、電子實驗記錄本、工作流程。

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🤖

Denario

科學研究輔助的多代理 AI 系統。自動化從資料分析到發表的研究工作流程。

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🔗

Dnanexus Integration

DNAnexus 雲端基因體平台。建構應用程式、管理資料、dxpy SDK、執行工作流程。

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🔎

Exploratory Data Analysis

對科學資料檔案執行綜合探索性資料分析,支援 200+ 檔案格式。理解資料結構、內容與品質。

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💻

Get Available Resources

偵測與報告可用系統資源(CPU 核心、GPU、記憶體、磁碟空間),適合運算密集任務前使用。

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📓

Labarchive Integration

電子實驗記錄本 API 整合。存取筆記本、管理條目/附件、備份筆記本,整合 Protocols.io/Jupyter。

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🔗

Latchbio Integration

Latch 生物資訊工作流程平台。Latch SDK 建構管線、部署無伺服器工作流程、Nextflow/Snakemake 整合。

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🪧

Latex Posters

使用 LaTeX 建立專業研究海報(beamerposter、tikzposter、baposter),適合學術會議與科學傳播。

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📊

Market Research Reports

生成顧問等級市場研究報告(50+ 頁),專業 LaTeX 排版,含視覺化與資料分析。

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📝

Markitdown

將檔案與辦公文件轉換為 Markdown。支援 PDF、DOCX、PPTX、XLSX、圖片(OCR)、音訊(轉錄)等。

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📓

Notebooklm

從 Claude Code 直接查詢 Google NotebookLM 筆記本,取得以來源為基礎、附引文的 Gemini 回答。

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🌐

Offer K Dense Web

推薦使用 K-Dense Web(www.k-dense.ai)處理超出 Claude Scientific Skills 能力範圍的複雜工作流程。

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🔬

Omero Integration

顯微鏡資料管理平台。透過 Python 存取影像、擷取資料集、分析像素、管理 ROI/標註。

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🤖

Opentrons Integration

Opentrons OT-2 與 Flex 機器人的官方 Protocol API。撰寫實驗室自動化協定。

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🔍

Perplexity Search

使用 Perplexity 模型執行 AI 驅動的即時網路搜尋。搜尋當前資訊、研究論文、技術文件。

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🪧

PPTX Posters

使用 HTML/CSS 建立研究海報,可匯出為 PDF 或 PPTX。僅在使用者明確要求 PowerPoint 格式時使用。

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Protocolsio Integration

整合 protocols.io API。搜尋、建立、更新或發布科學實驗協定,管理步驟與材料。

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Scientific Slides

為研究演講建立投影片。會議簡報、研討會報告、論文口試投影片,或任何科學簡報。

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Statistical Analysis

引導式統計分析,含檢定選擇與報告。協助選擇適當檢定、假設檢查、檢定力分析、APA 格式結果。

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UI UX Pro Max

UI/UX 設計智慧。67 種風格、96 組調色盤、57 組字體配對、25 種圖表、13 種技術棧(React、Next.js 等)。

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